防止和降低手术感染是手术室建设最基本的要求，感染控制的方法有：(1)通过术前备皮和术中对非手术区域的无菌覆盖，减少患者自身感染；(2)对手术器具和物品的严格消毒或隔离，减少外源接触感染；(3)降低空气中的灰尘和微生物粒子，减少悬浮污染物的扩散感染；(4)使用抗生素。这是一种补救措施，其靠药物去控制已发生的感染。

我国目前普遍存在的问题是，只注重预防感染结果，而忽略了对感染的全过程控制。临床表现是依靠大量抗生素来减少术后感染率，而对手术无菌过程缺乏严格控制。

为减少抗生素的滥用，必须提高手术室洁净水平，严格无菌操作和管理，加强对整个手术过程的控制，切断所有可能的污染途径(包括空气)，阻止细菌接触手术创口进入人体，这是当前医院感染控制建设的发展方向。